"Буду рад помочь Дидье (Дешаму), под руководством которого я выступал за "Монако", - приводит слова 33-летнего форварда официальный сайт "Марселя". - Он позвонил на прошлой неделе, и мне не пришлось долго раздумывать, чтобы дать согласие. Надеюсь, мой опыт поможет команде. Пока я нахожусь в не лучшей форме, но за несколько недель постараюсь набрать ее".

В Примере Морьентес дебютировал 7 ноября 1993 года, в 17 лет, в матче «Альбасете» — «Тенерифе». Затем в 1995 году перешел в «Сарагосу», где выступал на протяжении двух сезонов, забив 28 мячей.

В 1997 году получил приглашение в мадридский «Реала» - Фабио Капелло, тогдашний тренер команды, поручился за игрока перед руководством клуба, которое приняло решение о покупке молодого форварда. В первом сезоне в составе «Сливочных» забил 12 голов в 33 матчах. Позицию центрфорварда в команде Фернандо пришлось делить с Давором Шукером.

25 марта 1998 года состоялся дебют Морьентеса в национальной сборной Испании. Это был товарищеский матч со сборной Швеции. Нападающий вышел в стартовом составе и отметился двумя голами.

Ситуация в «Реале» для Морьентеса изменилась с появлением Роналдо. В сезоне 2002/03 в национальном чемпионате Фернандо сыграл только 18 матчей. Летом 2003 года «Реал» отдал его в аренду на один год французскому клубу «Монако». В новой команде форвард адаптировался очень быстро и стал одним из её лидеров. Он много играл и забивал. Более того, дошёл до финала этого турнира, где «Монако» уступил «Порту». По итогам первенства нападающий стал лучшим бомбардиром Лиги Чемпионов.

В 2004 году Морьентес по инициативе Рафаэля Бенитеса перешёл в английский «Ливерпуль». Впрочем никаких особых дивидендов от пребывания Морьентеса на туманном Альбионе ни он сам, ни «Ливерпуль» не получили. В 2006 году форвард вернулся в Испанию, подписав контракт с «Валенсией».

В минувшем сезоне экс-нападающий сборной Испании сыграл в Примере 20 матчей, забив лишь однажды.

Морьентес (27 голов в 47 матчах) является третьим бомбардиром в истории сборной Испании, уступая только бывшим одноклубникам по мадридскому "Реалу" Раулю (44 гола) и Фернандо Йерро (29 голов).